Đánh giá hiệu quả của Xét nghiệm Trusight Oncology 500 trong việc xác định mức độ gánh nặng đột biến khối u (TMB) trong điều kiện xét nghiệm thường quy và hiệu quả tiên lượng đáp ứng thuốc Pembrolizumab

Để mở rộng phạm vi đánh giá mối liên hệ giữa chỉ số TMB tỉ lệ đáp ứng với pembrolizumab, bộ KIT TruSight Oncology 500 (TSO500) được sử dụng để đánh giá các mẫu khối u lưu trữ từ 294 bệnh nhân, thu thập từ tám nghiên cứu đơn trị liệu bằng pembrolizumab. TSO500 là xét nghiệm giải trình tự thế hệ mới (NGS) với khả năng sử dụng rộng rãi, thời gian trả kết quả nhanh và quy trình phân tích tin sinh học được chuẩn hóa. Chỉ số TMB dựa trên bộ KIT TSO500 được đánh giá về mối tương quan và sự phù hợp với hai phương pháp tham chiếu là: FoundationOneCDx và giải trình tự toàn bộ exome. Ngưỡng giới hạn để xác định chỉ số TMB cao khi sử dụng KIT TSO500 được lựa chọn dựa trên phân tích đường cong ROC so sánh với với ngưỡng giới hạn của từng phương pháp tham chiếu. Ý nghĩa lâm sàng cho ngưỡng giới hạn 10 đột biến/Mb được đánh giá bằng cách tính toán độ nhạy, độ đặc hiệu, giá trị tiên đoán dương và giá trị tiên đoán âm, cũng như mức độ phong phú trong tỷ lệ đáp ứng khách quan (ORR). Kết quả cho thấy sự tương quan và phù hợp cao trong việc xác định chỉ số TMB bằng bộ KIT TSO500 so với với cả hai phương pháp tham chiếu. Chỉ số TMB đánh giá bằng bộ KIT TSO500 có liên quan đáng kể với tỉ lệ đáp ứng tổng thể tốt nhất và ngưỡng được chọn có ý nghĩa lâm sàng tương đương với ngưỡng tương ứng của các các phương pháp tham chiếu trong việc dự đoán đáp ứng với pembrolizumab. Là một bộ giải pháp xét nghiệm được thương mại hóa và được phân phối toàn cầu đi kèm giải pháp phân tích hoàn chỉnh, TSO500 có thể cung cấp thêm giải pháp để giúp các bệnh nhân có chỉ số TMB ≥10 đột biến/Mb có thể tiếp cận được liệu pháp miễn dịch.

Từ khóa: Trusight Oncology 500, Tumor Mutation Burden, Solid Tumor, Pembrolizumab

Table 2. Mức độ tương đồng giữa chỉ số TMB đánh giá bằng TSO500 so với FoundationOneCDx TMB và giải trình tự toàn bộ exome

Mối tương quan giữa chỉ số gánh nặng đột biến khối u (TMB) được đánh giá bởi TruSight Oncology 500 (TSO500) với FoundationOneCDx và giải trình tự toàn bộ exome (WES). A: Biểu đồ phân tán của TSO500 TMB với FoundationOneCDx TMB; đường thẳng đứng tương ứng với giới hạn TMB FoundationOneCDx đã thiết lập gồm 10 đột biến (mut)/Mb (N = 269 với điểm số TMB có thể đánh giá bằng cả hai xét nghiệm). B: Biểu đồ phân tán của TSO500 TMB với WES TMB; đường thẳng đứng tương ứng với ngưỡng WES TMB đã thiết lập là 175 đột biến/exome. Dữ liệu được vẽ trên thang log10 để hình dung rõ hơn mối tương quan ở điểm TMB thấp hơn (N = 293 với điểm TMB có thể đánh giá được bằng cả hai xét nghiệm). Cả hai lô được mã hóa màu cho các loại khối u chính. HNSCC, ung thư biểu mô tế bào vảy ở đầu và cổ; NSCLC, ung thư phổi không phải tế bào nhỏ; TNBC, ung thư vú bộ ba âm tính.

Kết luận

TSO500 có thể được sử dụng để đánh giá TMB một cách đáng tin cậy trong các mẫu FFPE lâm sàng và TMB được đánh giá bởi TSO500 có mối tương quan cao và phù hợp với TMB được xác định bởi 02 phương pháp tham chiếu: FoundationOneCDx và WES. Tương tự như mức giới hạn TMB 10 đột biến/Mb đã được Cục Quản lý Thực phẩm và Dược phẩm phê duyệt và đã được kiểm chứng bởi FoundationOneCDx, mức giới hạn 10 đột biến/Mb của TSO500 TMB được dự đoán là ngưỡng đáp ứng với đơn trị liệu bằng pembrolizumab. Sự tiến bộ của kỹ thuật giải trình tự NGS và phân tích tin sinh, việc đánh giá TMB là đáng tin cậy, do vậy TSO500 có thể được sử dụng trong các phòng thí nghiệm lâm sàng trên toàn cầu để đánh giá TMB, điều này có thể giúp tiếp cận nhiều hơn với liệu pháp miễn dịch cho bệnh nhân có khối u dạng đặc có điểm TMB là 10 đột biến/Mb hoặc cao hơn.

0